靖江科研試驗基地位于江蘇省靖江市孤山鎮通太村，總占地400.81畝，其中建設用地30.15畝、標準化試驗魚池31個170.66畝、稻漁共作試驗田200畝。2019年以來先后獲得農業農村部2個池塘改造項目（開放共享-長江下游生態漁業研究基地基礎設施改造項目、長江下游水生生物資源養護研究基地基礎設施改造項目）和1個基建項目（中國水產科學研究院淡水漁業研究中心水生動物疫病研究試驗基地）支持，建有綜合實驗室1635.37平方米、科研輔助用房989.3平方米、水生動物臨床試驗車間1509.75平方米。

基地聚焦“長江大保護”和“漁業綠色高質量發展”需求，致力于打造集活體保存、人工繁育、種業創新、疾病防控、綜合種養、信息交流等功能于一體的示范基地。基地在國家水產種質資源平臺的支持下，護存了刀鱭、鯔、銅魚、橄欖蟶蚌等特色物種40余種，基礎種群達5萬尾（只），為水生生物天然資源增殖養護和水產新品種創制提供了優良種質保障，為長江水生生物資源保護和高水平開發利用奠定了基礎。目前，基地以國家大宗淡水魚產業技術體系、特色淡水魚產業技術體系、蝦蟹產業技術體系、國家重點研發計劃等國家級、省部級任務為依托，重點開展水產種質資源保護與利用、水生動物疫病生態防治、漁農綜合種養模式構建等核心技術攻關，助力漁業高質量綠色發展、服務鄉村振興戰略。