水產養殖研究室現有科研人員12名，其中研究員3名，副研究員4名；碩士生導師5名，博士4名，在職博士生2名，碩士4名。近五年來承擔各級科研項目50余項，其中4項獲得省（部）級科技進步獎，獲授權國家發明專利28項；共發表論文100多篇；出版專著3本。依托研究室建有“江蘇省長江特色魚類協同創新中心”、“中國水產科學研究院長江特色魚類工程技術研究中心”、“中國水產科學研究院淡水蝦蟹養殖功能實驗室”、“中美淡水貝類種質資源保護及利用國際聯合實驗室”等科技創新平臺，并配置有全自動免疫組化及原位雜交染色成像工作站、厭氧操作系統、掃描電子顯微鏡及能譜儀、全自動營養鹽分析儀、程控降溫儀、熒光定量PCR儀等一批大型儀器設備，重點開展淡水水產生物繁育、淡水水產生物精細高效養殖等方面的研究開發。 

一、淡水水產生物繁育學科發展目標及重點研究方向
　　1.發展目標
　　圍繞長江刀鱭、美洲鰣、暗紋東方鲀、克氏原鰲蝦、中華絨螯蟹、三角帆蚌和紫黑翼蚌等重要水產生物的繁育效率、繁育模式、設施建設、質量保障及整體效益等五個方面，開展重要水產生物的親本培育技術、人工催產技術、人工授精技術、人工孵化技術、苗種培育技術等共性技術的集成、組裝、優化、配套，形成現代重要水產生物繁育技術體系。
　　2．重點研究方向
　　（1）規模化人工繁殖技術研究
　　（2）規模化苗種培育技術研究
　　（3）餌料生物配套培育技術研究
　　（4）苗種繁育設施與裝備技術研究
　　二、淡水水產生物健康養殖學科發展目標及重點研究方向
　　1.發展目標
　　針對我國傳統的淡水池塘養殖模式落后、養殖污染嚴重等問題，突破多元生態健康養殖、池塘集約化養殖、精準投喂等關鍵技術，全面提高集約化養殖水平；重點研究工業化循環水高效養殖裝備、設施及管理技術，以養殖環境高效調控為中心，建立苗種、飼料、病害、設施設備等生產過程管理技術，形成水產品可追溯的綜合精細高效養殖模式與技術，整體技術處于國內先進水平。
　　2．重點研究方向
  （1）池塘養殖生態系統關鍵調控技術研究
  （2）池塘復合養殖模式研究
  （3）池塘精細高效養殖及質量控制技術研究
  （4）池塘工業化生態養殖技術研究
  （5）工廠化養殖技術研究